Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Traf3Q60803 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms