Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms