Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Xrcc1Q60596 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Xrcc1Q60596 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Xrcc1Q60596 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Xrcc1Q60596 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Xrcc1Q60596 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Xrcc1Q60596 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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