Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp13a3Q5XF89 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms