Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms