Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms