Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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R3hdm4Q4VBF2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm4Q4VBF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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