Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Khdc1cQ4KL78 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Khdc1cQ4KL78 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Khdc1cQ4KL78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Khdc1cQ4KL78 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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