Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Syne3Q4FZC9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms