Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Krtap9-3Q3V2C1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms