Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms