Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Znf48Q3US17 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms