Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
E130208F15RikQ3UPV3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms