Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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