Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc33Q3ULW6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms