Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms