Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc177Q3UHB8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms