Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Parp8Q3UD82 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms