Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LbrQ3U9G9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LbrQ3U9G9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LbrQ3U9G9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LbrQ3U9G9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LbrQ3U9G9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms