Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssbp4Q3U4B1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssbp4Q3U4B1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssbp4Q3U4B1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ssbp4Q3U4B1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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