Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam117bQ3U3E2 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms