Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kdm4dQ3U2K5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms