Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc174Q3U155 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms