Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Palb2Q3U0P1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms