Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms