Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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