Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf3c3Q3TMP1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms