Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc10Q3TLI0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms