Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarca4Q3TKT4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms