Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp39Q3TIX9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp39Q3TIX9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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