Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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