Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Treml4Q3LRV9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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