Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms