Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms