Protein–RNA interactions for Protein: Q14B70

Hdx, Highly divergent homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdxQ14B70 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HdxQ14B70 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms