Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms