Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
StumQ0VBF8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms