Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem52bQ0VBF2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms