Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zc3h18Q0P678 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zc3h18Q0P678 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms