Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Neurl1bQ0MW30 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms