Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf541Q0GGX2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms