Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms