Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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