Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tff1Q08423 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms