Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Cnn1Q08091 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnn1Q08091 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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