Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms