Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms