Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms