Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1Q04750 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1Q04750 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms