Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff2Q03404 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms